Theo đó, Bộ VHTTDL thống nhất thỏa thuận Báo cáo KTKT tôn tạo đền Du Yến, hạng mục tôn tạo chùa Thiền Lâm với các nội dung: xây dựng mới Tam quan, Tam bảo (tiền  đường, Trung đường và Thượng điện), Nhà Tổ, Lầu hóa vàng, Trai đường và bếp.

Bộ VHTTDL cũng lưu ý một số vấn đề sau đây:

Đối với Tam bảo: Điều chỉnh thiết kế bờ nóc Trung đường thấp hơn bờ nóc Tiền đường và Thượng điện. Vị trí Hộ pháp cần đối xứng qua trục chính (bản vẽ TB-06).

Đối với Nhà tổ: Điều chỉnh thiết kế theo mẫu kiến trúc tường hồi bít đốc, giảm quy mô công trình theo hướng còn 05 gian và bờ nóc Nhà tổ thấp hơn bờ nóc Thượng điện.

Bổ sung phương án chiếu sáng sân vườn và nội thất các công trình, bố trí cây xanh trong khuôn viên chùa.

Chùa Thiền Lâm thuộc di tích đền Du Yến (xã Chí Tiên, huyện Thanh Ba, tỉnh Phú Thọ). Đền Du Yến (Đền Mẫu), là nơi thờ Công chúa Ngọc Loan. Đền được công nhận là di tích lịch sử cấp Quốc gia năm 1993. Lúc mới được khởi dựng, Đền Du Yến chỉ là một ngôi miếu thờ nhỏ và trải qua 2000 năm tu sửa và xây dựng lại mới có ngôi đền khang trang như bây giờ. Kiến trúc của đền Du Yến gồm tòa tiền tế 5 gian, hậu cung 3 gian, xây cổng, hành lang đúc thêm chuông và tôn tạo khu vực đền thâm nghiêm, cổ kính. Năm 2003, đền Du Yến được trùng tu lại toà tiền tế 5 gian, hậu cung 3 gian như hiện nay. Trong đền còn giữ được nhiều di vật quí như: Ngai thờ, kiệu bát cống, đồ chấp kích, bát bửu.../.