Ngoài ra, Hậu Giang còn có hệ thống sông ngòi, kênh rạch chằng chịt với tổng chiều dài khoảng 2.300 km, mật độ sông rạch khá lớn 1,5 km/km². Giao thông đường thủy thuận lợi như kênh xáng Xà No, kênh Quản Lộ Phụng Hiệp, sông Cái Côn, sông Hậu... Đây là những lợi thế để Hậu Giang phát triển du lịch đường thủy và hình thành các tuyến du lịch đường thủy liên vùng. Để khai thác và phát huy những lợi thế vừa nêu, Sở Văn hoá, Thể thao và Du lịch (VHTTDL) đã tham mưu triển khai phát triển các sản phẩm du lịch theo 03 tuyến: Tuyến du lịch kênh xáng Xà No; tuyến sông Cái Côn gắn với địa điểm chợ nổi Ngã Bảy và tuyến gắn với sông nước miệt vườn, bảo tồn cảnh quan đặc trưng sông nước dọc sông Hậu.

Theo đó, đối với Tuyến du lịch kênh xáng Xà No, Hậu Giang đã đưa vào vận hành và khai thác Tàu du lịch Xà No, giai đoạn đầu khai thác tuyến du lịch kênh xáng Xà No trong nội ô thành phố Vị Thanh. Song song đó, kết hợp tham quan các điểm trên tuyến du lịch kênh xáng Xà No như: Chợ Vị Thanh, di tích Chiến thắng Vàm Cái Sình, vùng khóm Cầu Đúc, vườn dâu Bé Hai, vườn dâu Má Ba, trải nghiệm trang trại sữa dê Ngọc Đào, nghỉ ngơi, vui chơi tại Homestay Mương Đình, các điểm du lịch sinh thái, vườn trái cây.... Không những vậy, để khai thác tuyến này, Sở VHTTDL tỉnh Hậu Giang cũng đã phối hợp với thành phố Cần Thơ liên kết các điểm du lịch trên tuyến sông Cần Thơ và kênh xáng Xà No hình thành tour, tuyến du lịch sông nước như: Chợ nổi Cái Răng - Điểm du lịch Cantho Eco Resort (huyện Phong Điền, Cần Thơ) - Trang trại sữa dê Ngọc Đào (huyện Châu Thành A, Hậu Giang) - Homestay Mương Đình (huyện Châu Thành A) - Di tích Quốc gia đặc biệt Chiến thắng Chương Thiện - Vùng du lịch khóm Cầu Đúc (thành phố Vị Thanh). Đối với tuyến sông Cái Côn gắn với địa điểm chợ nổi Ngã Bảy: Hậu Giang kết hợp tham quan địa điểm chợ nổi Ngã Bảy và các điểm du lịch trên tuyến như: các vườn trái cây (vườn dâu Thiên Ân, vườn dâu Út Ngân, vườn dâu Phương Nghi, vườn trái cây Chín Hùng, vườn trái cây Bảy Liễu...), di tích Ủy ban liên hợp đình chiến Nam bộ, khu du lịch sinh thái Mùa Xuân, nghề truyền thống đan đát... Hiện nay, tuyến du lịch này đã khai thác và mang lại hiệu quả bước đầu. Đối với tuyến gắn với sông nước miệt vườn, bảo tồn cảnh quan đặc trưng sông nước dọc sông Hậu: Hậu Giang đã tận dụng lợi thế đường sông dọc sông Hậu và các nhánh nhỏ như sông Mái Dầm (với lòng sông rộng và thoáng, cảnh quan hai bên sông mang đậm tính chất dân dã, giản dị với nhiều rặng dừa nước dọc theo bờ sông, cây bần, lục bình) và sông Ngã Sáu để phát triển du lịch đường thủy. Trên tuyến này, phát triển dịch vụ tham quan hệ sinh thái sông nước, miệt vườn, trải nghiệm đời sống lao động, hoạt động hằng ngày của người nông dân, nông nghiệp xanh sạch và bền vững, tham quan nông trại, nghề truyền thống, di tích lịch sử... hướng đến liên kết tuyến đường thủy với Cần Thơ, An Giang, Kiên Giang, Sóc Trăng...

Cùng với việc phát triển các sản phẩm du lịch, để phát triển du lịch đường thủy được đồng bộ, hiệu quả Hậu Giang định hướng sẽ triển khai đầu tư và kêu gọi đầu tư xây dựng hạ tầng, cơ sở vật chất kỹ thuật phục vụ các tuyến du lịch đường thủy như: Đầu tư, nâng cấp bến thủy nội địa tại các địa phương: Thành phố Vị Thanh, thành phố Ngã Bảy, huyện Châu Thành A, huyện Châu Thành; xây dựng nhà chờ tại bến tàu, bãi đỗ xe, nhà vệ sinh, nơi xử lý rác thải… gắn kết với các bến hành khách, đồng thời bố trí phương tiện giao thông để trung chuyển đón khách du lịch đến bằng đường thủy; chỉnh trang đô thị ven kênh, sông, trang trí, cải tạo cảnh quan dọc theo 02 bên bờ kênh xáng Xà No đoạn qua thành phố Vị Thanh, các dòng sông trên đoạn qua thành phố Ngã Bảy, dọc sông Hậu; xây dựng hệ thống bờ kè các doi ở Ngã Bảy để phục vụ phát triển du lịch sông nước; nâng cấp công trình cầu tàu, bờ kè, các tàu mô hình tại điểm phục hồi chợ nổi Ngã Bảy; nâng cấp hạ tầng giao thông đường bộ kết nối với các bến tàu; xây dựng, mở rộng bến bãi đậu xe khách; nạo vét một số tuyến đường thủy nội địa chính do tỉnh quản lý. Không dừng lại ở đó, Hậu Giang vận động, đầu tư, nâng cấp, xây dựng các khu, điểm du lịch sinh thái, du lịch nông nghiệp, du lịch cộng đồng để kết hợp khai thác đưa vào các tour du lịch đường thủy; kêu gọi đầu tư xây dựng phát triển một số công trình trọng điểm như: đài quan sát 7 nhánh sông trên cao; phục dựng chợ Nổi Ngã Bảy; phát triển các câu lạc bộ đờn ca tài tử cho khách du lịch thưởng thức trên thuyền, tàu du lịch tại các khu điểm du lịch dọc các tuyến du lịch đường thủy; tôn tạo và phát huy các di tích văn hóa lịch sử để phục vụ nhu cầu tham quan của khách du lịch; bảo tồn và phát triển các làng nghề truyền thống, thủ công mỹ nghệ; triển khai thực hiện trưng bày sản phẩm OCOP tại các bến tàu phục vụ khách du lịch; phát triển đội tàu, thuyền phục vụ nhu cầu tham quan trên sông, đảm bảo số lượng và chất lượng đáp ứng được nhu cầu khách tham quan.

Tăng cường công tác tuyên truyền, quảng bá xúc tiến điểm đến, các sản phẩm du lịch mới, hấp dẫn để quảng bá đến du khách, nhất là khách quốc tế; giới thiệu trên các nền tảng ứng dụng công nghệ số để thu hút khách du lịch; phối hợp với các đơn vị lữ hành trong và ngoài tỉnh kết nối tour, tuyến du lịch đường thủy kết hợp với đường bộ đưa khách đến tham quan các vườn cây ăn trái, các di tích lịch sử văn hóa, các làng nghề truyền thống, các khu, điểm du lịch trên địa bàn tỉnh. Tổ chức các lớp đào tạo, bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ cho đội ngũ phục vụ trên tàu, thuyền về kỹ năng đón tiếp khách, kỹ năng phục vụ, đáp ứng nhu cầu tham quan, thưởng ngoạn của du khách; giáo dục bồi dưỡng kiến thức về du lịch đường thủy cho cộng đồng dân cư tham gia làm du lịch trong việc kết hợp, khai thác du lịch đường thủy gắn với du lịch sinh thái, du lịch nông nghiệp, du lịch cộng đồng. Phối hợp, đẩy mạnh liên kết, khai thác các tour, tuyến du lịch đường thủy với thành phố Cần Thơ gắn kết với các khu, điểm du lịch trên địa bàn huyện Châu thành A, huyện Vị Thủy và thành phố Vị Thanh; mở rộng, kết nối tuyến Sài Gòn - Cà Mau (qua kênh Xà No); tuyến qua Rạch Giá (sông Cái Lớn đến ngã ba sông Cái Tư - kênh Tắt Cây Trâm); kết nối tuyến Cần Thơ - Cà Mau (kênh Quản Lộ - Phụng Hiệp), tuyến kênh xáng Sóc Trăng kết nối tỉnh Sóc Trăng,…/.