Mục tiêu Đề án là phát triển hệ thống sản phẩm du lịch đặc sắc, chất lượng cao; có giá trị gia tăng cao, thu hút thêm nhiều thị trường khách du lịch và thu hút các nguồn đầu tư lớn vào du lịch; đảm bảo tính bền vững và tính cạnh tranh trong khu vực và quốc tế. Đồng thời cụ thể hóa mục tiêu của các Nghị quyết 08-NQ/TW của Bộ Chính trị, ngày 16/1/2017 về phát triển du lịch trở thành ngành kinh tế mũi nhọn và Nghi quyết 36-NQ/TW của Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XII, ngày 22/10/2018 về Chiến lược phát triển bền vững kinh tế biển Việt Nam đến năm 2030, tầm nhìn chiến lược đến năm 2045. Quy hoạch phát triển kinh tế, xã hội và chủ trương, định hướng phát triển du lịch; định hướng phát triển du lịch Khánh Hòa theo hướng chất lượng cao, đẳng cấp quốc tế, đề xuất các giải pháp phát triển bền vững, phù hợp với tiềm năng lợi thế; thu hút các nhà đầu tư chiến lược có năng lực, kinh nghiệm đầu tư phát triển du lịch tại 3 vùng kinh tế trọng điểm của tỉnh và các khu vực có tiềm năng du lịch.

Bên cạnh đó, phát triển du lịch theo hướng chuyên nghiệp, hiệu quả, bền vững trên cơ sở bảo tồn hệ sinh thái biển, xây dựng các tổ hợp du lịch đẳng cấp, khác biệt, tạo kết nối tuyến du lịch đến các khu, điểm du lịch trong tỉnh, vùng, cả nước và quốc tế. Trong đó, đến năm 2025, loại hình du lịch nghỉ dưỡng và trải nghiệm vịnh – đảo Khánh Hòa trở thành sản phẩm du lịch có thương hiệu. Đến năm 2030, định vị rõ nét các dòng sản phẩm du lịch Khánh Hòa gắn với 4 vùng tài nguyên du lịch, gồm: Vùng du lịch trung tâm TP. Nha Trang, vùng du lịch phía Bắc Khánh Hòa, vùng du lịch phía Nam Khánh Hòa, vùng du lịch phía Tây Khánh Hòa. Trong đó, cùng với du lịch biển đảo, các dòng sản phẩn du lịch nghỉ dưỡng núi, du lịch sinh thái, du lịch mua sắm và chăm sóc sức khỏe sẽ là những sản phẩm thương hiệu, thu hút mạnh mẽ khách du lịch quốc tế và nội địa…